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-rw-r--r-- | mp.h | 6 |
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@@ -2,11 +2,15 @@ namespace mp { -static const double EPSILON = 1e-3; double euclidean(const arma::rowvec &x1, const arma::rowvec &x2); arma::mat dist(const arma::mat &X, double (*distCalc)(const arma::rowvec &, const arma::rowvec &) = euclidean); + arma::mat lamp(const arma::mat &X, const arma::uvec &sampleIndices, const arma::mat &Ys); void lamp(const arma::mat &X, const arma::uvec &sampleIndices, const arma::mat &Ys, arma::mat &Y); + arma::mat forceScheme(const arma::mat &D, arma::mat &Y, size_t maxIter = 20, double tol = 1e-3, double fraction = 8); +arma::mat tSNE(const arma::mat &X, arma::uword k = 2, double perplexity = 30, arma::uword nIter = 1000); +void tSNE(const arma::mat &X, arma::mat &Y, double perplexity = 30, arma::uword nIter = 1000); + } // namespace mp |